Les musées du Duomo, situés dans la zone de respect du site Unesco de Modène, complètent la visite de la cathédrale en permettant une compréhension complète de son histoire et de ses événements.
Elles comprennent une collection composée de fragments sculptés appartenant à la cathédrale et à ses prédécesseurs, et une autre composée d'œuvres et de meubles témoignant de la vitalité de l'Église modénaise au fil des siècles.
Le nouveau parcours de visite créé en 2023 au deuxième étage permet aux visiteurs de découvrir les principales étapes de l'histoire de l'ensemble monumental reconnu par l'Unesco en 1997 de manière interactive et engageante et d'apprécier les caractéristiques uniques et inédites qui ont motivé l'inscription de la cathédrale, de la tour Ghirlandina et de la Piazza Grande sur la liste du patrimoine mondial.